NVIDIA、2800超のウイルス構造を公開

NVIDIAは2026年9月24日、Google DeepMindや欧州バイオインフォマティクス研究所などとの国際連携で、2800超のウイルスが持つタンパク質複合体の予測3D構造をAlphaFold Databaseで無償公開したと発表しました。将来の感染症流行に備え、世界の研究者がワクチンや治療薬の標的候補を早く調べられる基盤を整える狙いです。

新データは、Google DeepMindのAlphaFold2をNVIDIA BioNeMo Inference Runtimeで最適化し、数千のウイルスの全タンパク質群を一括処理して作られました。NVIDIAは、研究者が独自の標的配列から予測構造を得られるGPU対応の予測工程もオープンソースで公開します。

追加されたタンパク質相互作用の約30％は、実験で構造が確定したデータを集めるProtein Data Bankに記録がない新しい形状です。予測には信頼度が示されるため、研究者は有望な仮説を選び、実験で確かめる出発点として利用できます。

タンパク質は多くの場合、複数の分子が集まった複合体として働き、その形状はウイルスの働きを妨げるワクチンや薬の標的になります。研究チームは、風邪の原因ウイルスからMpoxのような新興脅威まで、人に感染することが知られるウイルス群を体系的に調べました。

従来のX線解析などは構造1件に数年と数千ドルを要する場合がありますが、最適化したAlphaFold2は数分で構造を予測し、大量処理も可能だとNVIDIAは説明します。公開先のAlphaFold Databaseは現在、ほぼすべての既知タンパク質を対象に2億6000万超の予測を収録し、設備や資金が限られる地域の研究者にも感染症対策の基礎情報を届けます。